Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms