Protein–RNA interactions for Protein: Q96M43

NBPF4, Neuroblastoma breakpoint family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF4Q96M43 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBPF4Q96M43 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBPF4Q96M43 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBPF4Q96M43 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBPF4Q96M43 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms