Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AC018362.2-202ENST00000567089 562 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AL354892.3-201ENST00000586101 1630 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AC093297.2-201ENST00000503452 738 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 MEG8-208ENST00000553465 1176 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AC090527.1-201ENST00000557965 431 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 RN7SL819P-201ENST00000581896 270 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AC006511.4-201ENST00000631571 561 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 RLN2-201ENST00000381627 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AC098483.1-202ENST00000436515 967 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 CENPK-211ENST00000510693 1040 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms