Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD2Q96BF3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms