Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTSSAQ969W0 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms