Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms