Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
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PTPRUQ92729 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
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PTPRUQ92729 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
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PTPRUQ92729 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
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PTPRUQ92729 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
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PTPRUQ92729 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
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PTPRUQ92729 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
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PTPRUQ92729 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
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PTPRUQ92729 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
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