Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms