Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RGP1Q92546 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms