Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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COPS9Q8WXC6 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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COPS9Q8WXC6 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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COPS9Q8WXC6 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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