Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms