Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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ZNF439Q8NDP4 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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ZNF439Q8NDP4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF439Q8NDP4 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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