Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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C9orf40Q8IXQ3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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C9orf40Q8IXQ3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf40Q8IXQ3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf40Q8IXQ3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf40Q8IXQ3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf40Q8IXQ3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf40Q8IXQ3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf40Q8IXQ3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf40Q8IXQ3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf40Q8IXQ3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf40Q8IXQ3 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf40Q8IXQ3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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C9orf40Q8IXQ3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf40Q8IXQ3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf40Q8IXQ3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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C9orf40Q8IXQ3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf40Q8IXQ3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf40Q8IXQ3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf40Q8IXQ3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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C9orf40Q8IXQ3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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C9orf40Q8IXQ3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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C9orf40Q8IXQ3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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C9orf40Q8IXQ3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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C9orf40Q8IXQ3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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C9orf40Q8IXQ3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf40Q8IXQ3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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C9orf40Q8IXQ3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf40Q8IXQ3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf40Q8IXQ3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf40Q8IXQ3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf40Q8IXQ3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf40Q8IXQ3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf40Q8IXQ3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf40Q8IXQ3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf40Q8IXQ3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf40Q8IXQ3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf40Q8IXQ3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf40Q8IXQ3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf40Q8IXQ3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf40Q8IXQ3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf40Q8IXQ3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf40Q8IXQ3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf40Q8IXQ3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf40Q8IXQ3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf40Q8IXQ3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf40Q8IXQ3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf40Q8IXQ3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf40Q8IXQ3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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