Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PBRM1Q86U86 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PBRM1Q86U86 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PBRM1Q86U86 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PBRM1Q86U86 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PBRM1Q86U86 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PBRM1Q86U86 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PBRM1Q86U86 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PBRM1Q86U86 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PBRM1Q86U86 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PBRM1Q86U86 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PBRM1Q86U86 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PBRM1Q86U86 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PBRM1Q86U86 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PBRM1Q86U86 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PBRM1Q86U86 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PBRM1Q86U86 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PBRM1Q86U86 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PBRM1Q86U86 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PBRM1Q86U86 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PBRM1Q86U86 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PBRM1Q86U86 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PBRM1Q86U86 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PBRM1Q86U86 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PBRM1Q86U86 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PBRM1Q86U86 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PBRM1Q86U86 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PBRM1Q86U86 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PBRM1Q86U86 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms