Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z460

CLASP1, CLIP-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLASP1Q7Z460 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLASP1Q7Z460 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLASP1Q7Z460 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLASP1Q7Z460 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLASP1Q7Z460 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms