Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NUP54Q7Z3B4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms