Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BEND4Q6ZU67 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms