Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDC4Q6P2E9 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms