Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRAMD4Q6IC98 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms