Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUPD1Q68J44 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUPD1Q68J44 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUPD1Q68J44 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUPD1Q68J44 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUPD1Q68J44 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUPD1Q68J44 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUPD1Q68J44 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DUPD1Q68J44 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DUPD1Q68J44 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DUPD1Q68J44 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DUPD1Q68J44 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DUPD1Q68J44 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUPD1Q68J44 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms