Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms