Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL12Q53G59 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms