Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms