Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms