Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms