Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGSM1Q2NKQ1 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGSM1Q2NKQ1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGSM1Q2NKQ1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGSM1Q2NKQ1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGSM1Q2NKQ1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SGSM1Q2NKQ1 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGSM1Q2NKQ1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGSM1Q2NKQ1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGSM1Q2NKQ1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SGSM1Q2NKQ1 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGSM1Q2NKQ1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGSM1Q2NKQ1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGSM1Q2NKQ1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGSM1Q2NKQ1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGSM1Q2NKQ1 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGSM1Q2NKQ1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGSM1Q2NKQ1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGSM1Q2NKQ1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGSM1Q2NKQ1 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SGSM1Q2NKQ1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGSM1Q2NKQ1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGSM1Q2NKQ1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGSM1Q2NKQ1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGSM1Q2NKQ1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGSM1Q2NKQ1 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGSM1Q2NKQ1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGSM1Q2NKQ1 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGSM1Q2NKQ1 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGSM1Q2NKQ1 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGSM1Q2NKQ1 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGSM1Q2NKQ1 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGSM1Q2NKQ1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGSM1Q2NKQ1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGSM1Q2NKQ1 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGSM1Q2NKQ1 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms