Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms