Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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