Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ME3Q16798 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ME3Q16798 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ME3Q16798 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ME3Q16798 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ME3Q16798 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ME3Q16798 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ME3Q16798 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ME3Q16798 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ME3Q16798 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ME3Q16798 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ME3Q16798 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ME3Q16798 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ME3Q16798 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ME3Q16798 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ME3Q16798 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ME3Q16798 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ME3Q16798 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ME3Q16798 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ME3Q16798 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ME3Q16798 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ME3Q16798 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ME3Q16798 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ME3Q16798 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ME3Q16798 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ME3Q16798 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ME3Q16798 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ME3Q16798 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ME3Q16798 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ME3Q16798 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ME3Q16798 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ME3Q16798 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ME3Q16798 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ME3Q16798 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ME3Q16798 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ME3Q16798 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ME3Q16798 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ME3Q16798 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ME3Q16798 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ME3Q16798 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ME3Q16798 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ME3Q16798 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ME3Q16798 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ME3Q16798 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ME3Q16798 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ME3Q16798 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ME3Q16798 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ME3Q16798 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ME3Q16798 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ME3Q16798 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ME3Q16798 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ME3Q16798 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ME3Q16798 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ME3Q16798 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ME3Q16798 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ME3Q16798 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ME3Q16798 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ME3Q16798 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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ME3Q16798 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ME3Q16798 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ME3Q16798 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ME3Q16798 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ME3Q16798 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ME3Q16798 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ME3Q16798 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ME3Q16798 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ME3Q16798 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ME3Q16798 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ME3Q16798 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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ME3Q16798 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME3Q16798 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME3Q16798 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME3Q16798 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME3Q16798 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME3Q16798 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME3Q16798 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME3Q16798 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME3Q16798 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME3Q16798 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME3Q16798 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME3Q16798 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ME3Q16798 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME3Q16798 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME3Q16798 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME3Q16798 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME3Q16798 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME3Q16798 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ME3Q16798 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME3Q16798 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ME3Q16798 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME3Q16798 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME3Q16798 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME3Q16798 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME3Q16798 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME3Q16798 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ME3Q16798 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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