Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA9Q16790 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA9Q16790 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA9Q16790 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA9Q16790 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA9Q16790 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA9Q16790 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA9Q16790 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA9Q16790 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA9Q16790 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA9Q16790 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CA9Q16790 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA9Q16790 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA9Q16790 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA9Q16790 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA9Q16790 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA9Q16790 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA9Q16790 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA9Q16790 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA9Q16790 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA9Q16790 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA9Q16790 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA9Q16790 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CA9Q16790 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA9Q16790 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA9Q16790 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA9Q16790 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA9Q16790 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA9Q16790 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA9Q16790 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA9Q16790 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA9Q16790 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA9Q16790 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA9Q16790 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA9Q16790 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA9Q16790 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA9Q16790 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CA9Q16790 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CA9Q16790 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CA9Q16790 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CA9Q16790 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CA9Q16790 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CA9Q16790 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CA9Q16790 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CA9Q16790 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CA9Q16790 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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CA9Q16790 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CA9Q16790 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CA9Q16790 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CA9Q16790 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
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CA9Q16790 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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CA9Q16790 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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CA9Q16790 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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CA9Q16790 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CA9Q16790 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CA9Q16790 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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CA9Q16790 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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CA9Q16790 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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CA9Q16790 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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CA9Q16790 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CA9Q16790 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CA9Q16790 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CA9Q16790 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CA9Q16790 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CA9Q16790 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
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CA9Q16790 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CA9Q16790 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CA9Q16790 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CA9Q16790 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CA9Q16790 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CA9Q16790 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CA9Q16790 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CA9Q16790 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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CA9Q16790 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CA9Q16790 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CA9Q16790 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CA9Q16790 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CA9Q16790 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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