Protein–RNA interactions for Protein: Q16763

UBE2S, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 S, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2SQ16763 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBE2SQ16763 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBE2SQ16763 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBE2SQ16763 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBE2SQ16763 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2SQ16763 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2SQ16763 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2SQ16763 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2SQ16763 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2SQ16763 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2SQ16763 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2SQ16763 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2SQ16763 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2SQ16763 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2SQ16763 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2SQ16763 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2SQ16763 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2SQ16763 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2SQ16763 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2SQ16763 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2SQ16763 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms