Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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