Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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