Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NTRK2Q16620 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms