Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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EXT1Q16394 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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EXT1Q16394 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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EXT1Q16394 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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