Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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ZIC1Q15915 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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ZIC1Q15915 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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