Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NEDD8Q15843 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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