Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms