Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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