Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

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Length 786 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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