Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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