Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB35Q15286 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB35Q15286 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB35Q15286 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB35Q15286 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB35Q15286 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB35Q15286 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB35Q15286 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB35Q15286 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB35Q15286 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB35Q15286 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB35Q15286 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB35Q15286 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB35Q15286 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB35Q15286 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB35Q15286 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB35Q15286 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB35Q15286 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB35Q15286 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB35Q15286 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB35Q15286 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB35Q15286 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB35Q15286 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB35Q15286 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB35Q15286 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB35Q15286 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB35Q15286 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB35Q15286 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB35Q15286 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB35Q15286 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB35Q15286 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB35Q15286 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB35Q15286 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB35Q15286 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB35Q15286 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB35Q15286 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB35Q15286 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB35Q15286 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB35Q15286 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB35Q15286 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB35Q15286 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB35Q15286 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB35Q15286 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB35Q15286 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB35Q15286 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB35Q15286 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB35Q15286 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB35Q15286 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB35Q15286 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB35Q15286 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB35Q15286 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB35Q15286 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB35Q15286 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB35Q15286 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB35Q15286 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB35Q15286 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB35Q15286 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB35Q15286 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB35Q15286 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB35Q15286 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB35Q15286 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB35Q15286 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB35Q15286 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB35Q15286 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB35Q15286 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB35Q15286 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB35Q15286 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB35Q15286 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB35Q15286 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB35Q15286 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB35Q15286 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB35Q15286 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB35Q15286 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB35Q15286 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB35Q15286 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB35Q15286 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB35Q15286 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB35Q15286 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB35Q15286 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB35Q15286 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB35Q15286 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB35Q15286 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB35Q15286 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB35Q15286 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB35Q15286 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB35Q15286 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB35Q15286 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB35Q15286 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB35Q15286 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB35Q15286 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB35Q15286 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB35Q15286 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB35Q15286 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB35Q15286 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB35Q15286 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB35Q15286 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB35Q15286 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB35Q15286 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB35Q15286 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB35Q15286 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms