Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
R3HDM1Q15032 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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