Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPD2Q15021 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms