Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
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