Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE1CQ14123 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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