Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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