Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
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