Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATP1A4Q13733 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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