Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTCH1Q13635 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
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